Ο γονότυπος είναι το σύνολο των γονιδίων ενός ατόμου, συμπεριλαμβανομένων των γενετικών παραλλαγών που έχει. Είναι το σύνολο των γονιδίων που κληρονομούνται και από τους δύο γονείς. Ο γονότυπος καθορίζει τα κληρονομικά χαρακτηριστικά ενός ατόμου. Ο γονότυπος μπορεί να προσδιοριστεί με την αλληλούχιση του γονιδιώματος ενός ατόμου.